水体生态修复：用于富营养化水体的治理，通过向水体中投放含有光合细菌、硝化细菌等微生物的复合微生物肥料，可以分解水体中的有机物和氮、磷等营养物质，抑制有害藻类的生长，改善水质，恢复水体的生态功能.园林养护城市绿化植物养护：在城市公园、街道绿化等园林植物的养护中，复合微生物肥料可以提高土壤肥力，增强植物的抗逆性，减少病虫害的发生，降低养护成本！同时，使用微生物肥料符合城市生态环保的要求，有助于打造绿色、健康的城市生态环境.

　　活化磷、钾元素：土壤中的磷和钾元素大部分以难溶性的形态存在，植物难以直接吸收利用!微生物肥料中的磷、钾细菌能够通过分泌有机酸、酶等物质，将难溶性的磷、钾转化为可溶性状态，提高土壤中磷、钾元素的有效性，增加土壤的供肥能力！改善土壤物理性质促进土壤团粒结构形成：微生物在土壤中的活动可以促进土壤团粒结构的形成！微生物分泌的多糖等物质能够将土壤颗粒粘结在一起，形成团聚体，改善土壤的通气性和透水性.良好的土壤团粒结构有利于植物根系的生长和发育，提高土壤的保水保肥能力！

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　　提高肥料利用率：一些微生物能与土壤中的固氮菌共生，固定空气中的氮素，为花卉提供氮源，减少氮肥施用量！同时，微生物的代谢活动还能产生酸性物质，降低土壤酸碱度，使土壤中难溶性的养分更容易被花卉吸收！促进根系发育分泌生长物质：微生物菌剂中的特定微生物能够分泌生长素、细胞素、赤霉素等植物生长激素，刺激花卉根系的生长和发育，使根系更加发达，增强根系对水分和养分的吸收能力!改善根际环境：有益微生物在花卉根系周围形成优势菌群，抑制有害微生物的生长和繁殖，减少根部病害的发生.

　　微生物肥料的作用对植物生长的直接作用促进植物根系发育增加根际微生物数量和多样性：微生物肥料中的有益微生物能够在植物根际大量繁殖，形成优势菌群。这些微生物的活动可以改善根际土壤环境，增强根系的吸收能力!例如，一些微生物能够分泌生长素等植物激素，刺激根系细胞的和伸长，使根系更加发达，从而增加植物对水分和养分的吸收面积!改善根系形态和结构：微生物肥料中的特定微生物可以与植物根系形成共生关系，如豆科植物与根瘤菌形成的根瘤共生体！

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　　调节植物内源激素水平：微生物在与植物相互作用的过程中，能够调节植物内源激素的水平，使植物生长更加健壮，增强植物的抗病能力！例如，一些微生物能够促进植物脱落酸的合成，脱落酸可以提高植物的抗逆性，增强植物对病害的抵抗能力。对生态环境的保护作用减少化肥使用量：微生物肥料能够为植物提供养分，提高土壤肥力，从而减少化肥的使用量。化肥的过量使用会导致土壤板结、水体富营养化、温室气体排放等一系列环境问题。使用微生物肥料可以降低对化肥的依赖，减少化肥对环境的污染，保护生态环境！

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　　根瘤菌可以在豆科植物的根系上形成根瘤，将空气中的氮气转化为植物可利用的氨态氮，同时为植物提供一定的生长激素，促进根系的生长和发育，使根系形态更加完善，结构更加合理！促进植物地上部分生长提供营养物质：一些微生物肥料中的微生物能够分解土壤中有机物质，释放出氮、磷、钾等营养元素以及铁、锌等微量元素，供植物吸收利用！例如，磷细菌能够将土壤中难溶性的磷转化为可溶性磷，钾细菌能够释放出土壤中的钾元素，满足植物生长对养分的需求，促进植物地上部分的生长和发育!

　　花卉种植：可以为花卉提供的营养，促进花卉的生长和开花，使花朵更加鲜艳、花期更长.还能改良土壤，增强土壤的保水保肥能力，有利于花卉根系的生长和发育!生态修复土壤修复：在受污染的土壤中，复合微生物肥料中的微生物可以分解和转化土壤中的有害物质，如重金属、有机物污染物等，降低其对环境的污染风险，同时改善土壤的结构和功能，恢复土壤的生态平衡.例如在一些重金属污染的土地上施用含有特定微生物的复合微生物肥料，可以逐渐降低土壤中重金属的含量，使土壤得到修复.