CellDataSciences专注于改善对具有挑战性的生物样本的遗传和基因组数据的获取,使用我们的试剂盒,FFPE样品的用户即使从质量较差的样品中也可以自信地提取RNA.CELLDATA的使命是在具有挑战性的生物样本上使用先进的分子分析技术,并提高基础科学和个性化医疗的关键遗传和基因组数据的恢复。更高质量的核酸大多数现有方法依靠热量来去除交联和加合物,这仅部分有效,并导致不稳定核酸的额外断裂!相比之下,RNAstorm™和DNAstorm™套件中包含的催化CAT5™技术大大加速了甲醛损伤的去除,并允许回收更高质量的核酸!
该试剂盒旨在为各种应用提供高核酸质量,包括RNA-Seq、NanostringnCounter和RT-PCR,并依赖于允许在温和条件下分离核酸的专有化学。提高RNA分离重要的质量指标:总产量、完整性和可扩增性”,RNAstorm试剂盒避免使用破坏性条件和化学品。三个产品:福尔马林固定和石蜡包埋(FFPE)组织提取DNA试剂盒;福尔马林固定和石蜡包埋(FFPE)组织提取RNA试剂盒;新鲜细胞和组织提取RNA试剂盒!
两个包埋组织DNA/RNA提取试剂盒的优势是:拥有专利的组织裂解液,可以减少甲醛和DNA/RNA的交联,提高产量和减少DNA/RNA的破坏,而且步骤简单时间短.细胞数据科学DNAstorm™FFPE试剂盒——提取高质量FFPE组织DNADNAstorm™的优势:◆减少DNA损伤◆除去化学修饰和核酸加合物◆简单的工作流程◆下一代测序的佳解决方案CAT5™催化技术:◆自有知识产权的化学催化剂:可消除甲醛的交联和变性◆比使用基于加热方法产量更高◆高质量:DNA片段极少应用领域二代测序、核酸扩增、定量核酸扩增操作方式手动(50个核酸纯化柱)RNase处理已包含样品量福尔马林固定样品(1-4片,5-10µm)提取时间45分钟操作时间试剂盒成份CAT5™裂解缓冲液结合缓冲液洗涤缓冲液脱石蜡试剂蛋白酶K核糖核酸酶A核酸纯化柱利用RNAstorm™试剂盒提取具有更好的扩增性和完整性的RNA,催化FFPE核酸分离以获得佳的NGS性能介绍活检和手术标本被常规保存用甲醛固定,用福尔马林固定石蜡固定嵌入式(FFPE)组织块格式。
storm™工具包RNAstorm™萃取试剂盒包括化学催化剂,包括在烷基化和交联的碱基上。这专有的CAT5™技术被证明可以导致RNA具有更高的质量和产量,更好的完整性,该试剂盒提供了所有必要的试剂来提取总试剂来自FFPE组织样本的RNA遵循用户友好的亲亲可以在1小时内完成准时!在使用切片机进行切片后,该组织首先使用无二甲苯溶液进行脱亲和!然后,用CAT5™试剂处理组织并进行裂解,使用蛋白酶溶液。与旋转柱结合后洗涤后,RNA用DNaseI处理以去除con-污染基因组DNA.
d)继续孵育上清液,再培养1。在72˚C下运行5小时(总共2小时,包括初的30分钟),然后按照指示进行RNAstorm™协议的步骤7步(添加绑定缓冲区)和所有剩余步骤.e)使用步骤b)中的颗粒,其中包含DNA,作为DNAStorm™试剂盒手册的步骤A5(或B8,取决于脱亲和选择)的输入。f)继续执行DNAStorm协议的步骤A5(或B8),向颗粒中添加200µL的CAT5™缓冲区,然后按照DNAStorm™协议的指示继续操作.
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这表明RNA的完整性、化学修饰和交联的程度对这里测试的样品起着重要作用,通常在FFPE样品的qPCR性能中起重要作用。使用RNAstorm™试剂盒观察到RNA完整性的增加使用毛细管电泳也观察到RNA完整性的增加.样品使用RNA进行处理安捷伦2100生物分析仪上的6000纳米总RNA试剂盒,数据使用安捷伦专家软件进行分析!结论据估计,目前全球生物样本库中存在数亿份患者FFPE样本,每年还会产生数百万份患者FFPE样本!
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几种类型的正常和肿瘤FFPE标本!古老的样本是在1976年确定的,新的样本是在2015年.采用定量RT-PCR方法对可扩增的RNA进行相对定量!Ct值重复测量三次.使用一个高表达基因(TPT1)的83bp扩增子,并分析熔体曲线以确保特异性扩增!RNAstorm™试剂盒大幅增加了可扩增RNA的产量,虽然Qubit测量的RNA浓度通常也更高(数据未显示),但仅这些浓度差异并不足以解释RNAStorm™试剂盒和KitQ之间Ct值的巨大差异。